Il existe une rumeur qui dit qu'il existerait une horloge qui contrôle le passage du temps au sein de l'académie. Elle serait gérer par trois gardien qui s'occuperait respectivement du passé, du présent et du futur. Mais soudainement, les élèves commencent à vieillir subitement ainsi que les structures du bâtiment. Nene décide de prendre les choses en main et demande à Hanako-kun de l'aider à découvrir qui se cache derrière ce nouveau mystère!