Il y a deux ans, Keitarou Gentouga, un jeune étudiant doué d’une capacité spirituelle, a été blessé par un esprit. Depuis, il vit reclus dans sa chambre pour éviter les fantômes. Grâce à son amie Eiko Houzuki, il finit par reprendre confiance et retrouver une vie sociale. Elle lui propose de devenir le tuteur de sa cousine Yayoi pour se réinsérer en société. Mais, il s’avère que cette dernière est un petit génie qui possède également des pouvoirs spirituels. Celle-ci est bien décidée à retrouver le fantôme qui a tué sa mère. Elle va entraîner Keitarou dans sa recherche en visitant des lieux hantés au grand dam de celui-ci…