De jeunes gens disposant de super-pouvoirs, les « Prodiges », ont été rassemblés dans une école sur une île isolée et sont entraînés jour et nuit pour combattre une menace appelée « les ennemis de l'humanité ». Parmi eux figure Nana Hiiragi, une nouvelle élève tout juste transférée. Sans talent particulier, elle prétend toutefois être capable de lire dans les pensées. Cela dit, sous ses airs de jeune fille inoffensive, Nana semble être animée par une mission de la plus haute importance...